C’est une partie de notre système nerveux qui n’est pas dépendant de notre volonté. Il commande à notre insu notre cœur, nos poumons, notre appareil digestif ; il dilate nos pupilles, envoie du sang aux muscles via la dilatation des vaisseaux en cas de danger, ou bien il calme le jeu, en ralentissant les battements cardiaques ; il augmente les sécrétions salivaires ou gastriques. Ce système ne passe pas par notre cerveau, il est contenu dans notre moelle épinière.
Les fibres nerveuses de ce système autonome circulent entre les vertèbres. A chaque étage correspond un organe. Elles peuvent être comprimées, comme le nerf sciatique, et engendrer des désordres sur les viscères : c’est ce qu’on appelle les réflexes somato-viscéraux.
Les mêmes fibres sont aussi impliquées dans les phénomènes de stress et de troubles du sommeil.